Η χρήση φυτοφαρμάκων και χημικών λιπασμάτων διαταράσσει την ισορροπία των μικροβίων και θρεπτικών συστατικών του εδάφους, υποβαθμίζοντας έτσι την ποιότητα του. Μακροχρόνια χρήση μπορεί να επιφέρει την πλήρη υποβάθμιση και αχρηστία του εδάφους για καλλιέργεια. Τα χημικά λιπάσματα αν και χρησιμοποιούνται για να θρέψουν τα φυτά, καταλήγουν να καταστρέφουν την μικροβιακή πανίδα του εδάφους υποβαθμίζοντας την ποιότητα του. Η χρήση φυτοφαρμάκων μπορεί να οδηγήσει στην ανάπτυξη ανθεκτικότητας, κάνοντας συγκεκριμένα έντομα ανθεκτικά σε συγκεκριμένες χημικές ουσίες, ενώ παράλληλα καταστρέφονται πολλά ωφέλιμα είδη τα οποία βοηθούν στη διατήρηση των φυσικών ισορροπιών στη μικροπανίδα και μικροβιακή χλωρίδα του εδάφους.

H υγεία και παραγωγικότητα των καλλιεργειών εξαρτάται κατά κύριο λόγο από την ποιότητα του εδάφους. Το χώμα πρέπει να έχει την κατάλληλη περιεκτικότητα σε θρεπτικά συστατικά, αφού η έλλειψη ή υπέρβαση αυτών, διαταράσσει την ανάπτυξη. Όταν το έδαφος είναι φτωχό σε θρεπτικά συστατικά, αντί της προσθήκης χημικών λιπασμάτων που θα καταστρέψουν την ισορροπία της εδαφικής πανίδας, είναι προτιμότερο να προστεθεί επιλεκτικά το θρεπτικό συστατικό που λείπει από το χώμα και είναι αναγκαίο για την αύξηση της παραγωγικότητας στην συγκεκριμένη καλλιέργεια.
Στη βάση αυτής της αρχής, η εργαστηριακή ομάδα του Αρχιπελάγους προσφέρει δωρεάν αναλύσεις ποιότητας εδάφους στους γεωργούς, οι οποίοι ενημερώνονται για την περιεκτικότητα των εδαφών τους σε θρεπτικά συστατικά.
Το εργαστήριο του Αρχιπελάγους πραγματοποιεί αναλύσεις εδάφους για τις παρακάτω παραμέτρους:
Αμμωνία, Ασβέστιο, Χλώριο, Ελεύθερο Χλώριο, Χαλκό, Σίδηρο, pH, Μαγνήσιο, Μαγγάνιο, Νιτρικά, Νιτρώδη, Φωσφορικά, Φώσφορο.